La perfetta conservazione dell'olio consente di preservarlo dai suoi più acerrimi nemici: luce, calore e ossigeno che possono danneggiare irrimediabilmente le caratteristiche chimiche ed organolettiche anche del più favoloso olio extravergine. Caratteristica peculiare della Coop. San Francesco è la conservazione in cisterne rivestite di acciaio inossidabile, o silos, che costituiscono il moderno sistema di immagazzinamento di grandi quantitativi d'olio. Esse sono caratterizzate da grande facilità di lavaggio e opacità in modo da offrire le migliori garanzie di conservazione.